Protein–RNA interactions for Protein: Q640N1

Aebp1, Adipocyte enhancer-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aebp1Q640N1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Aebp1Q640N1 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Aebp1Q640N1 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Aebp1Q640N1 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Aebp1Q640N1 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Aebp1Q640N1 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Aebp1Q640N1 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Aebp1Q640N1 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Aebp1Q640N1 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Aebp1Q640N1 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Aebp1Q640N1 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Aebp1Q640N1 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
Aebp1Q640N1 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Aebp1Q640N1 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Aebp1Q640N1 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Aebp1Q640N1 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Aebp1Q640N1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Aebp1Q640N1 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Aebp1Q640N1 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Aebp1Q640N1 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Aebp1Q640N1 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Aebp1Q640N1 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Aebp1Q640N1 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Aebp1Q640N1 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Aebp1Q640N1 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Aebp1Q640N1 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Aebp1Q640N1 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Aebp1Q640N1 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Aebp1Q640N1 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Aebp1Q640N1 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Aebp1Q640N1 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Aebp1Q640N1 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Aebp1Q640N1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Aebp1Q640N1 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Aebp1Q640N1 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Aebp1Q640N1 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Aebp1Q640N1 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Aebp1Q640N1 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Aebp1Q640N1 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Aebp1Q640N1 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Aebp1Q640N1 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Aebp1Q640N1 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Aebp1Q640N1 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Aebp1Q640N1 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Aebp1Q640N1 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Aebp1Q640N1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Aebp1Q640N1 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Aebp1Q640N1 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Aebp1Q640N1 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Aebp1Q640N1 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Aebp1Q640N1 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Aebp1Q640N1 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Aebp1Q640N1 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Aebp1Q640N1 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Aebp1Q640N1 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Aebp1Q640N1 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Aebp1Q640N1 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Aebp1Q640N1 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Aebp1Q640N1 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Aebp1Q640N1 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Aebp1Q640N1 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Aebp1Q640N1 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Aebp1Q640N1 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Aebp1Q640N1 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Aebp1Q640N1 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Aebp1Q640N1 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Aebp1Q640N1 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Aebp1Q640N1 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Aebp1Q640N1 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Aebp1Q640N1 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Aebp1Q640N1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Aebp1Q640N1 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Aebp1Q640N1 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Aebp1Q640N1 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Aebp1Q640N1 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Aebp1Q640N1 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Aebp1Q640N1 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Aebp1Q640N1 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Aebp1Q640N1 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Aebp1Q640N1 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Aebp1Q640N1 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Aebp1Q640N1 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Aebp1Q640N1 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Aebp1Q640N1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Aebp1Q640N1 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Aebp1Q640N1 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Aebp1Q640N1 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Aebp1Q640N1 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Aebp1Q640N1 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Aebp1Q640N1 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Aebp1Q640N1 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Aebp1Q640N1 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Aebp1Q640N1 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Aebp1Q640N1 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Aebp1Q640N1 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Aebp1Q640N1 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Aebp1Q640N1 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Aebp1Q640N1 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Aebp1Q640N1 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Aebp1Q640N1 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms