Protein–RNA interactions for Protein: Q62507

Coch, Cochlin, mousemouse

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Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CochQ62507 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CochQ62507 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CochQ62507 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CochQ62507 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CochQ62507 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CochQ62507 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CochQ62507 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CochQ62507 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CochQ62507 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CochQ62507 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CochQ62507 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CochQ62507 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CochQ62507 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CochQ62507 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CochQ62507 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CochQ62507 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CochQ62507 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CochQ62507 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CochQ62507 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CochQ62507 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CochQ62507 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CochQ62507 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CochQ62507 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CochQ62507 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CochQ62507 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CochQ62507 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CochQ62507 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CochQ62507 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CochQ62507 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CochQ62507 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CochQ62507 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CochQ62507 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CochQ62507 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CochQ62507 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CochQ62507 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CochQ62507 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CochQ62507 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CochQ62507 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CochQ62507 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CochQ62507 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CochQ62507 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CochQ62507 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CochQ62507 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CochQ62507 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CochQ62507 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CochQ62507 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CochQ62507 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CochQ62507 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CochQ62507 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CochQ62507 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CochQ62507 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CochQ62507 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CochQ62507 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CochQ62507 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CochQ62507 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CochQ62507 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CochQ62507 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CochQ62507 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CochQ62507 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CochQ62507 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CochQ62507 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CochQ62507 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CochQ62507 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CochQ62507 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CochQ62507 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CochQ62507 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CochQ62507 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CochQ62507 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CochQ62507 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CochQ62507 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CochQ62507 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CochQ62507 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CochQ62507 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CochQ62507 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CochQ62507 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CochQ62507 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CochQ62507 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CochQ62507 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CochQ62507 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CochQ62507 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CochQ62507 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CochQ62507 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CochQ62507 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CochQ62507 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CochQ62507 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CochQ62507 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CochQ62507 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CochQ62507 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CochQ62507 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CochQ62507 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CochQ62507 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CochQ62507 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CochQ62507 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CochQ62507 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CochQ62507 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CochQ62507 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CochQ62507 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CochQ62507 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CochQ62507 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CochQ62507 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms