Protein–RNA interactions for Protein: Q62447

Ccnc, Cyclin-C, mousemouse

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Length 283 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcncQ62447 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CcncQ62447 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CcncQ62447 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CcncQ62447 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CcncQ62447 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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CcncQ62447 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CcncQ62447 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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CcncQ62447 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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CcncQ62447 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CcncQ62447 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CcncQ62447 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CcncQ62447 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CcncQ62447 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CcncQ62447 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CcncQ62447 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms