Protein–RNA interactions for Protein: Q62433

Ndrg1, Protein NDRG1, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndrg1Q62433 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndrg1Q62433 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndrg1Q62433 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndrg1Q62433 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndrg1Q62433 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndrg1Q62433 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndrg1Q62433 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndrg1Q62433 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndrg1Q62433 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndrg1Q62433 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndrg1Q62433 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndrg1Q62433 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndrg1Q62433 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndrg1Q62433 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndrg1Q62433 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndrg1Q62433 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndrg1Q62433 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndrg1Q62433 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndrg1Q62433 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndrg1Q62433 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndrg1Q62433 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndrg1Q62433 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndrg1Q62433 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndrg1Q62433 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndrg1Q62433 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndrg1Q62433 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndrg1Q62433 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndrg1Q62433 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndrg1Q62433 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndrg1Q62433 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndrg1Q62433 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndrg1Q62433 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndrg1Q62433 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ndrg1Q62433 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ndrg1Q62433 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ndrg1Q62433 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ndrg1Q62433 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ndrg1Q62433 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ndrg1Q62433 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ndrg1Q62433 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ndrg1Q62433 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ndrg1Q62433 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ndrg1Q62433 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ndrg1Q62433 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ndrg1Q62433 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ndrg1Q62433 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ndrg1Q62433 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndrg1Q62433 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndrg1Q62433 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndrg1Q62433 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndrg1Q62433 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndrg1Q62433 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndrg1Q62433 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndrg1Q62433 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndrg1Q62433 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndrg1Q62433 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndrg1Q62433 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndrg1Q62433 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndrg1Q62433 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndrg1Q62433 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndrg1Q62433 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndrg1Q62433 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndrg1Q62433 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndrg1Q62433 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndrg1Q62433 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndrg1Q62433 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndrg1Q62433 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndrg1Q62433 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndrg1Q62433 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndrg1Q62433 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndrg1Q62433 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndrg1Q62433 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndrg1Q62433 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndrg1Q62433 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndrg1Q62433 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndrg1Q62433 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndrg1Q62433 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndrg1Q62433 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndrg1Q62433 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndrg1Q62433 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndrg1Q62433 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndrg1Q62433 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndrg1Q62433 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndrg1Q62433 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndrg1Q62433 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndrg1Q62433 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndrg1Q62433 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndrg1Q62433 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndrg1Q62433 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndrg1Q62433 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndrg1Q62433 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndrg1Q62433 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndrg1Q62433 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndrg1Q62433 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndrg1Q62433 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndrg1Q62433 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndrg1Q62433 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndrg1Q62433 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndrg1Q62433 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndrg1Q62433 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms