Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Kdm5dQ62240 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Kdm5dQ62240 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Kdm5dQ62240 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Kdm5dQ62240 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Kdm5dQ62240 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Kdm5dQ62240 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Kdm5dQ62240 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Kdm5dQ62240 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Kdm5dQ62240 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Kdm5dQ62240 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Kdm5dQ62240 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Kdm5dQ62240 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Kdm5dQ62240 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Kdm5dQ62240 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Kdm5dQ62240 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Kdm5dQ62240 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Kdm5dQ62240 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Kdm5dQ62240 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Kdm5dQ62240 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Kdm5dQ62240 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Kdm5dQ62240 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Kdm5dQ62240 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Kdm5dQ62240 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Kdm5dQ62240 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Kdm5dQ62240 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Kdm5dQ62240 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Kdm5dQ62240 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Kdm5dQ62240 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Kdm5dQ62240 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Kdm5dQ62240 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Kdm5dQ62240 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Kdm5dQ62240 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Kdm5dQ62240 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Kdm5dQ62240 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Kdm5dQ62240 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Kdm5dQ62240 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Kdm5dQ62240 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Kdm5dQ62240 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Kdm5dQ62240 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Kdm5dQ62240 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Kdm5dQ62240 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Kdm5dQ62240 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC27.51■■■□□ 2
Kdm5dQ62240 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC27.51■■■□□ 2
Kdm5dQ62240 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC27.51■■■□□ 2
Kdm5dQ62240 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Kdm5dQ62240 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Kdm5dQ62240 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC27.51■■■□□ 2
Kdm5dQ62240 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Kdm5dQ62240 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Kdm5dQ62240 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Kdm5dQ62240 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Kdm5dQ62240 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Kdm5dQ62240 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Kdm5dQ62240 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Kdm5dQ62240 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Kdm5dQ62240 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Kdm5dQ62240 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Kdm5dQ62240 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Kdm5dQ62240 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Kdm5dQ62240 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Kdm5dQ62240 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Kdm5dQ62240 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Kdm5dQ62240 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Kdm5dQ62240 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Kdm5dQ62240 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Kdm5dQ62240 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Kdm5dQ62240 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Kdm5dQ62240 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Kdm5dQ62240 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Kdm5dQ62240 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Kdm5dQ62240 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Kdm5dQ62240 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Kdm5dQ62240 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Kdm5dQ62240 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Kdm5dQ62240 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Kdm5dQ62240 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Kdm5dQ62240 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Kdm5dQ62240 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Kdm5dQ62240 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Kdm5dQ62240 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Kdm5dQ62240 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Kdm5dQ62240 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Kdm5dQ62240 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Kdm5dQ62240 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Kdm5dQ62240 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Kdm5dQ62240 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Kdm5dQ62240 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Kdm5dQ62240 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Kdm5dQ62240 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Kdm5dQ62240 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Kdm5dQ62240 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Kdm5dQ62240 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Kdm5dQ62240 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Kdm5dQ62240 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Kdm5dQ62240 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Kdm5dQ62240 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Kdm5dQ62240 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Kdm5dQ62240 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Kdm5dQ62240 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.4 ms