Protein–RNA interactions for Protein: Q62231

Six1, Homeobox protein SIX1, mousemouse

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Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six1Q62231 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Six1Q62231 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Six1Q62231 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Six1Q62231 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Six1Q62231 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Six1Q62231 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Six1Q62231 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Six1Q62231 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Six1Q62231 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Six1Q62231 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Six1Q62231 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Six1Q62231 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Six1Q62231 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Six1Q62231 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Six1Q62231 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Six1Q62231 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Six1Q62231 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Six1Q62231 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Six1Q62231 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Six1Q62231 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Six1Q62231 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Six1Q62231 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Six1Q62231 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Six1Q62231 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Six1Q62231 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Six1Q62231 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Six1Q62231 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Six1Q62231 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Six1Q62231 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Six1Q62231 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Six1Q62231 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Six1Q62231 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Six1Q62231 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Six1Q62231 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms