Protein–RNA interactions for Protein: Q62167

Ddx3x, ATP-dependent RNA helicase DDX3X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx3xQ62167 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddx3xQ62167 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddx3xQ62167 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddx3xQ62167 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddx3xQ62167 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddx3xQ62167 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddx3xQ62167 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddx3xQ62167 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddx3xQ62167 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddx3xQ62167 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddx3xQ62167 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddx3xQ62167 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddx3xQ62167 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddx3xQ62167 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddx3xQ62167 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddx3xQ62167 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddx3xQ62167 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddx3xQ62167 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddx3xQ62167 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddx3xQ62167 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddx3xQ62167 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddx3xQ62167 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddx3xQ62167 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddx3xQ62167 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddx3xQ62167 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddx3xQ62167 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddx3xQ62167 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddx3xQ62167 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddx3xQ62167 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddx3xQ62167 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddx3xQ62167 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddx3xQ62167 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddx3xQ62167 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddx3xQ62167 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddx3xQ62167 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddx3xQ62167 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddx3xQ62167 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddx3xQ62167 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddx3xQ62167 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddx3xQ62167 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddx3xQ62167 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddx3xQ62167 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddx3xQ62167 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddx3xQ62167 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddx3xQ62167 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddx3xQ62167 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddx3xQ62167 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddx3xQ62167 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddx3xQ62167 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddx3xQ62167 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddx3xQ62167 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddx3xQ62167 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddx3xQ62167 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddx3xQ62167 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddx3xQ62167 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddx3xQ62167 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddx3xQ62167 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddx3xQ62167 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddx3xQ62167 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddx3xQ62167 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddx3xQ62167 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddx3xQ62167 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddx3xQ62167 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddx3xQ62167 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddx3xQ62167 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddx3xQ62167 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddx3xQ62167 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddx3xQ62167 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddx3xQ62167 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddx3xQ62167 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ddx3xQ62167 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ddx3xQ62167 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ddx3xQ62167 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ddx3xQ62167 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ddx3xQ62167 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ddx3xQ62167 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ddx3xQ62167 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ddx3xQ62167 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ddx3xQ62167 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddx3xQ62167 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddx3xQ62167 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddx3xQ62167 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddx3xQ62167 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddx3xQ62167 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddx3xQ62167 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddx3xQ62167 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddx3xQ62167 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddx3xQ62167 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddx3xQ62167 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddx3xQ62167 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddx3xQ62167 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddx3xQ62167 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddx3xQ62167 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddx3xQ62167 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddx3xQ62167 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddx3xQ62167 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddx3xQ62167 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddx3xQ62167 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddx3xQ62167 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddx3xQ62167 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms