Protein–RNA interactions for Protein: Q62158

Trim27, Zinc finger protein RFP, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim27Q62158 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim27Q62158 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim27Q62158 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim27Q62158 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim27Q62158 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim27Q62158 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim27Q62158 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim27Q62158 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Trim27Q62158 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Trim27Q62158 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim27Q62158 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim27Q62158 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim27Q62158 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim27Q62158 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim27Q62158 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim27Q62158 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim27Q62158 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim27Q62158 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim27Q62158 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Trim27Q62158 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Trim27Q62158 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim27Q62158 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim27Q62158 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim27Q62158 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Trim27Q62158 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Trim27Q62158 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim27Q62158 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Trim27Q62158 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Trim27Q62158 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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Trim27Q62158 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim27Q62158 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim27Q62158 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim27Q62158 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim27Q62158 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim27Q62158 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim27Q62158 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim27Q62158 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim27Q62158 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim27Q62158 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim27Q62158 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim27Q62158 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim27Q62158 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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Trim27Q62158 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim27Q62158 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim27Q62158 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim27Q62158 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim27Q62158 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim27Q62158 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim27Q62158 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim27Q62158 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim27Q62158 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim27Q62158 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim27Q62158 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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