Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms