Protein–RNA interactions for Protein: Q61313

Tfap2b, Transcription factor AP-2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2bQ61313 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tfap2bQ61313 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tfap2bQ61313 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tfap2bQ61313 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tfap2bQ61313 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tfap2bQ61313 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tfap2bQ61313 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tfap2bQ61313 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tfap2bQ61313 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tfap2bQ61313 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tfap2bQ61313 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tfap2bQ61313 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tfap2bQ61313 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tfap2bQ61313 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tfap2bQ61313 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tfap2bQ61313 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tfap2bQ61313 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tfap2bQ61313 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tfap2bQ61313 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tfap2bQ61313 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tfap2bQ61313 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tfap2bQ61313 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tfap2bQ61313 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tfap2bQ61313 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tfap2bQ61313 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tfap2bQ61313 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tfap2bQ61313 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tfap2bQ61313 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tfap2bQ61313 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tfap2bQ61313 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tfap2bQ61313 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tfap2bQ61313 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tfap2bQ61313 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tfap2bQ61313 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tfap2bQ61313 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tfap2bQ61313 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tfap2bQ61313 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tfap2bQ61313 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tfap2bQ61313 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tfap2bQ61313 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tfap2bQ61313 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tfap2bQ61313 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tfap2bQ61313 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tfap2bQ61313 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tfap2bQ61313 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tfap2bQ61313 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tfap2bQ61313 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tfap2bQ61313 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tfap2bQ61313 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tfap2bQ61313 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tfap2bQ61313 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tfap2bQ61313 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tfap2bQ61313 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tfap2bQ61313 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tfap2bQ61313 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tfap2bQ61313 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tfap2bQ61313 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tfap2bQ61313 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tfap2bQ61313 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tfap2bQ61313 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tfap2bQ61313 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tfap2bQ61313 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tfap2bQ61313 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tfap2bQ61313 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tfap2bQ61313 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tfap2bQ61313 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tfap2bQ61313 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tfap2bQ61313 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tfap2bQ61313 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tfap2bQ61313 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms