Protein–RNA interactions for Protein: Q61290

Cacna1e, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, mousemouse

Predictions only

Length 2,272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1eQ61290 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cacna1eQ61290 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cacna1eQ61290 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cacna1eQ61290 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Cacna1eQ61290 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Cacna1eQ61290 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Cacna1eQ61290 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cacna1eQ61290 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cacna1eQ61290 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cacna1eQ61290 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Cacna1eQ61290 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cacna1eQ61290 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cacna1eQ61290 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cacna1eQ61290 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cacna1eQ61290 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cacna1eQ61290 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cacna1eQ61290 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cacna1eQ61290 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cacna1eQ61290 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cacna1eQ61290 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cacna1eQ61290 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cacna1eQ61290 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cacna1eQ61290 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cacna1eQ61290 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cacna1eQ61290 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cacna1eQ61290 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cacna1eQ61290 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cacna1eQ61290 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cacna1eQ61290 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cacna1eQ61290 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cacna1eQ61290 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cacna1eQ61290 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cacna1eQ61290 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cacna1eQ61290 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cacna1eQ61290 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cacna1eQ61290 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cacna1eQ61290 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cacna1eQ61290 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cacna1eQ61290 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cacna1eQ61290 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cacna1eQ61290 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cacna1eQ61290 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cacna1eQ61290 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cacna1eQ61290 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cacna1eQ61290 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cacna1eQ61290 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cacna1eQ61290 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cacna1eQ61290 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cacna1eQ61290 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms