Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms