Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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JrkQ60976 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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JrkQ60976 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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JrkQ60976 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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JrkQ60976 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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JrkQ60976 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
JrkQ60976 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
JrkQ60976 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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JrkQ60976 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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JrkQ60976 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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JrkQ60976 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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JrkQ60976 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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JrkQ60976 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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JrkQ60976 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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JrkQ60976 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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JrkQ60976 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
JrkQ60976 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
JrkQ60976 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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