Protein–RNA interactions for Protein: Q60974

Ncor1, Nuclear receptor corepressor 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncor1Q60974 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ncor1Q60974 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ncor1Q60974 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ncor1Q60974 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ncor1Q60974 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ncor1Q60974 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ncor1Q60974 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ncor1Q60974 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ncor1Q60974 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ncor1Q60974 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ncor1Q60974 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ncor1Q60974 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ncor1Q60974 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ncor1Q60974 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Ncor1Q60974 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ncor1Q60974 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ncor1Q60974 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ncor1Q60974 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ncor1Q60974 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ncor1Q60974 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ncor1Q60974 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ncor1Q60974 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Ncor1Q60974 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ncor1Q60974 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Ncor1Q60974 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Ncor1Q60974 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Ncor1Q60974 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Ncor1Q60974 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ncor1Q60974 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Ncor1Q60974 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Ncor1Q60974 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ncor1Q60974 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ncor1Q60974 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ncor1Q60974 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ncor1Q60974 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ncor1Q60974 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ncor1Q60974 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ncor1Q60974 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ncor1Q60974 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ncor1Q60974 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ncor1Q60974 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ncor1Q60974 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ncor1Q60974 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ncor1Q60974 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ncor1Q60974 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ncor1Q60974 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ncor1Q60974 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ncor1Q60974 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ncor1Q60974 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ncor1Q60974 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ncor1Q60974 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ncor1Q60974 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ncor1Q60974 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ncor1Q60974 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ncor1Q60974 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ncor1Q60974 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ncor1Q60974 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ncor1Q60974 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ncor1Q60974 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ncor1Q60974 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ncor1Q60974 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ncor1Q60974 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ncor1Q60974 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ncor1Q60974 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ncor1Q60974 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ncor1Q60974 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ncor1Q60974 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ncor1Q60974 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ncor1Q60974 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ncor1Q60974 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ncor1Q60974 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ncor1Q60974 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ncor1Q60974 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ncor1Q60974 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ncor1Q60974 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ncor1Q60974 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ncor1Q60974 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ncor1Q60974 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ncor1Q60974 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ncor1Q60974 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ncor1Q60974 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ncor1Q60974 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ncor1Q60974 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ncor1Q60974 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ncor1Q60974 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ncor1Q60974 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ncor1Q60974 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ncor1Q60974 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ncor1Q60974 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ncor1Q60974 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ncor1Q60974 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ncor1Q60974 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ncor1Q60974 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ncor1Q60974 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ncor1Q60974 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ncor1Q60974 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ncor1Q60974 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ncor1Q60974 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ncor1Q60974 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ncor1Q60974 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms