Protein–RNA interactions for Protein: Q60925

Dbp, D site-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbpQ60925 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DbpQ60925 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DbpQ60925 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DbpQ60925 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DbpQ60925 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DbpQ60925 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DbpQ60925 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DbpQ60925 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DbpQ60925 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DbpQ60925 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DbpQ60925 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DbpQ60925 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
DbpQ60925 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DbpQ60925 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DbpQ60925 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
DbpQ60925 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DbpQ60925 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
DbpQ60925 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DbpQ60925 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DbpQ60925 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DbpQ60925 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DbpQ60925 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
DbpQ60925 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DbpQ60925 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DbpQ60925 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DbpQ60925 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DbpQ60925 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DbpQ60925 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DbpQ60925 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DbpQ60925 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DbpQ60925 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DbpQ60925 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DbpQ60925 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DbpQ60925 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DbpQ60925 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DbpQ60925 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DbpQ60925 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DbpQ60925 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DbpQ60925 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DbpQ60925 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DbpQ60925 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DbpQ60925 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DbpQ60925 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DbpQ60925 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DbpQ60925 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DbpQ60925 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DbpQ60925 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DbpQ60925 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DbpQ60925 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DbpQ60925 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DbpQ60925 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DbpQ60925 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DbpQ60925 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DbpQ60925 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DbpQ60925 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DbpQ60925 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DbpQ60925 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DbpQ60925 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DbpQ60925 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
DbpQ60925 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
DbpQ60925 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
DbpQ60925 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DbpQ60925 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DbpQ60925 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DbpQ60925 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DbpQ60925 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DbpQ60925 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DbpQ60925 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DbpQ60925 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DbpQ60925 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DbpQ60925 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DbpQ60925 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DbpQ60925 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
DbpQ60925 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DbpQ60925 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DbpQ60925 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DbpQ60925 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DbpQ60925 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DbpQ60925 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DbpQ60925 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DbpQ60925 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DbpQ60925 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DbpQ60925 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DbpQ60925 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DbpQ60925 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DbpQ60925 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DbpQ60925 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DbpQ60925 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DbpQ60925 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DbpQ60925 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DbpQ60925 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DbpQ60925 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DbpQ60925 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DbpQ60925 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DbpQ60925 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DbpQ60925 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DbpQ60925 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DbpQ60925 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DbpQ60925 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DbpQ60925 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms