Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms