Protein–RNA interactions for Protein: Q60772

Cdkn2c, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor C, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2cQ60772 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdkn2cQ60772 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdkn2cQ60772 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdkn2cQ60772 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdkn2cQ60772 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdkn2cQ60772 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdkn2cQ60772 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdkn2cQ60772 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdkn2cQ60772 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdkn2cQ60772 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdkn2cQ60772 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdkn2cQ60772 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdkn2cQ60772 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdkn2cQ60772 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdkn2cQ60772 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdkn2cQ60772 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdkn2cQ60772 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdkn2cQ60772 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdkn2cQ60772 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdkn2cQ60772 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdkn2cQ60772 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdkn2cQ60772 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdkn2cQ60772 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdkn2cQ60772 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdkn2cQ60772 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdkn2cQ60772 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdkn2cQ60772 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdkn2cQ60772 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdkn2cQ60772 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdkn2cQ60772 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdkn2cQ60772 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdkn2cQ60772 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdkn2cQ60772 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdkn2cQ60772 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdkn2cQ60772 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdkn2cQ60772 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdkn2cQ60772 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdkn2cQ60772 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdkn2cQ60772 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdkn2cQ60772 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdkn2cQ60772 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdkn2cQ60772 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdkn2cQ60772 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdkn2cQ60772 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdkn2cQ60772 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdkn2cQ60772 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdkn2cQ60772 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdkn2cQ60772 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdkn2cQ60772 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdkn2cQ60772 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdkn2cQ60772 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdkn2cQ60772 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdkn2cQ60772 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdkn2cQ60772 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdkn2cQ60772 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdkn2cQ60772 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdkn2cQ60772 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdkn2cQ60772 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdkn2cQ60772 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdkn2cQ60772 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdkn2cQ60772 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cdkn2cQ60772 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cdkn2cQ60772 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cdkn2cQ60772 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cdkn2cQ60772 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Cdkn2cQ60772 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdkn2cQ60772 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdkn2cQ60772 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdkn2cQ60772 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdkn2cQ60772 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdkn2cQ60772 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdkn2cQ60772 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdkn2cQ60772 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdkn2cQ60772 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdkn2cQ60772 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdkn2cQ60772 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdkn2cQ60772 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdkn2cQ60772 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdkn2cQ60772 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdkn2cQ60772 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdkn2cQ60772 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdkn2cQ60772 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdkn2cQ60772 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdkn2cQ60772 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cdkn2cQ60772 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cdkn2cQ60772 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cdkn2cQ60772 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cdkn2cQ60772 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cdkn2cQ60772 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cdkn2cQ60772 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cdkn2cQ60772 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cdkn2cQ60772 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cdkn2cQ60772 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cdkn2cQ60772 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cdkn2cQ60772 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cdkn2cQ60772 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cdkn2cQ60772 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cdkn2cQ60772 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cdkn2cQ60772 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cdkn2cQ60772 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms