Protein–RNA interactions for Protein: Q60715

P4ha1, Prolyl 4-hydroxylase subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P4ha1Q60715 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P4ha1Q60715 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P4ha1Q60715 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P4ha1Q60715 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P4ha1Q60715 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P4ha1Q60715 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P4ha1Q60715 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P4ha1Q60715 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P4ha1Q60715 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P4ha1Q60715 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P4ha1Q60715 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P4ha1Q60715 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P4ha1Q60715 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P4ha1Q60715 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P4ha1Q60715 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P4ha1Q60715 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P4ha1Q60715 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P4ha1Q60715 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P4ha1Q60715 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P4ha1Q60715 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P4ha1Q60715 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P4ha1Q60715 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
P4ha1Q60715 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P4ha1Q60715 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P4ha1Q60715 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P4ha1Q60715 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P4ha1Q60715 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P4ha1Q60715 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P4ha1Q60715 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P4ha1Q60715 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P4ha1Q60715 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P4ha1Q60715 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P4ha1Q60715 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P4ha1Q60715 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P4ha1Q60715 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P4ha1Q60715 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P4ha1Q60715 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P4ha1Q60715 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P4ha1Q60715 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P4ha1Q60715 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P4ha1Q60715 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P4ha1Q60715 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P4ha1Q60715 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P4ha1Q60715 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P4ha1Q60715 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P4ha1Q60715 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P4ha1Q60715 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P4ha1Q60715 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P4ha1Q60715 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P4ha1Q60715 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P4ha1Q60715 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P4ha1Q60715 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P4ha1Q60715 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P4ha1Q60715 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P4ha1Q60715 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P4ha1Q60715 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P4ha1Q60715 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P4ha1Q60715 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
P4ha1Q60715 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
P4ha1Q60715 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P4ha1Q60715 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P4ha1Q60715 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P4ha1Q60715 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P4ha1Q60715 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P4ha1Q60715 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P4ha1Q60715 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P4ha1Q60715 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P4ha1Q60715 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P4ha1Q60715 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P4ha1Q60715 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P4ha1Q60715 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P4ha1Q60715 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P4ha1Q60715 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P4ha1Q60715 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P4ha1Q60715 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P4ha1Q60715 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P4ha1Q60715 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P4ha1Q60715 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P4ha1Q60715 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P4ha1Q60715 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P4ha1Q60715 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P4ha1Q60715 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P4ha1Q60715 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P4ha1Q60715 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P4ha1Q60715 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P4ha1Q60715 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P4ha1Q60715 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P4ha1Q60715 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P4ha1Q60715 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P4ha1Q60715 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P4ha1Q60715 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P4ha1Q60715 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P4ha1Q60715 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
P4ha1Q60715 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
P4ha1Q60715 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
P4ha1Q60715 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
P4ha1Q60715 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P4ha1Q60715 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P4ha1Q60715 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P4ha1Q60715 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms