Protein–RNA interactions for Protein: Q60714

Slc27a1, Long-chain fatty acid transport protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a1Q60714 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc27a1Q60714 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc27a1Q60714 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc27a1Q60714 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc27a1Q60714 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc27a1Q60714 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc27a1Q60714 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc27a1Q60714 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc27a1Q60714 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc27a1Q60714 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc27a1Q60714 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc27a1Q60714 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc27a1Q60714 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc27a1Q60714 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc27a1Q60714 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc27a1Q60714 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc27a1Q60714 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc27a1Q60714 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc27a1Q60714 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc27a1Q60714 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc27a1Q60714 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc27a1Q60714 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc27a1Q60714 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc27a1Q60714 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc27a1Q60714 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc27a1Q60714 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc27a1Q60714 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc27a1Q60714 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc27a1Q60714 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc27a1Q60714 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc27a1Q60714 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc27a1Q60714 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc27a1Q60714 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc27a1Q60714 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc27a1Q60714 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc27a1Q60714 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc27a1Q60714 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc27a1Q60714 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc27a1Q60714 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc27a1Q60714 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc27a1Q60714 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc27a1Q60714 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc27a1Q60714 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc27a1Q60714 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc27a1Q60714 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc27a1Q60714 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc27a1Q60714 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc27a1Q60714 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc27a1Q60714 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc27a1Q60714 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc27a1Q60714 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc27a1Q60714 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc27a1Q60714 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc27a1Q60714 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc27a1Q60714 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc27a1Q60714 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc27a1Q60714 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc27a1Q60714 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc27a1Q60714 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc27a1Q60714 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc27a1Q60714 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc27a1Q60714 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc27a1Q60714 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc27a1Q60714 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc27a1Q60714 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc27a1Q60714 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc27a1Q60714 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc27a1Q60714 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc27a1Q60714 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc27a1Q60714 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc27a1Q60714 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc27a1Q60714 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc27a1Q60714 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc27a1Q60714 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc27a1Q60714 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc27a1Q60714 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc27a1Q60714 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc27a1Q60714 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc27a1Q60714 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc27a1Q60714 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc27a1Q60714 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc27a1Q60714 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc27a1Q60714 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc27a1Q60714 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc27a1Q60714 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc27a1Q60714 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc27a1Q60714 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc27a1Q60714 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc27a1Q60714 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc27a1Q60714 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc27a1Q60714 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc27a1Q60714 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc27a1Q60714 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc27a1Q60714 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc27a1Q60714 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc27a1Q60714 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc27a1Q60714 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc27a1Q60714 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc27a1Q60714 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc27a1Q60714 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms