Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

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Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trim38Q5SZ99 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim38Q5SZ99 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Trim38Q5SZ99 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim38Q5SZ99 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim38Q5SZ99 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
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Trim38Q5SZ99 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Trim38Q5SZ99 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Trim38Q5SZ99 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Trim38Q5SZ99 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim38Q5SZ99 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim38Q5SZ99 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim38Q5SZ99 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim38Q5SZ99 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Trim38Q5SZ99 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Trim38Q5SZ99 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim38Q5SZ99 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Trim38Q5SZ99 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim38Q5SZ99 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim38Q5SZ99 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim38Q5SZ99 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim38Q5SZ99 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim38Q5SZ99 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim38Q5SZ99 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim38Q5SZ99 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim38Q5SZ99 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim38Q5SZ99 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim38Q5SZ99 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim38Q5SZ99 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim38Q5SZ99 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim38Q5SZ99 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim38Q5SZ99 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim38Q5SZ99 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim38Q5SZ99 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim38Q5SZ99 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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