Protein–RNA interactions for Protein: Q5SX40

Myh1, Myosin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myh1Q5SX40 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Myh1Q5SX40 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Myh1Q5SX40 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Myh1Q5SX40 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Myh1Q5SX40 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Myh1Q5SX40 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Myh1Q5SX40 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Myh1Q5SX40 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Myh1Q5SX40 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Myh1Q5SX40 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Myh1Q5SX40 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Myh1Q5SX40 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Myh1Q5SX40 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Myh1Q5SX40 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Myh1Q5SX40 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Myh1Q5SX40 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Myh1Q5SX40 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Myh1Q5SX40 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Myh1Q5SX40 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Myh1Q5SX40 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Myh1Q5SX40 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Myh1Q5SX40 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Myh1Q5SX40 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Myh1Q5SX40 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Myh1Q5SX40 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Myh1Q5SX40 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Myh1Q5SX40 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Myh1Q5SX40 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Myh1Q5SX40 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Myh1Q5SX40 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Myh1Q5SX40 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Myh1Q5SX40 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Myh1Q5SX40 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Myh1Q5SX40 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Myh1Q5SX40 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Myh1Q5SX40 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Myh1Q5SX40 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Myh1Q5SX40 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Myh1Q5SX40 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Myh1Q5SX40 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Myh1Q5SX40 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms