Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Utp18Q5SSI6 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Utp18Q5SSI6 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Utp18Q5SSI6 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Utp18Q5SSI6 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Utp18Q5SSI6 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Utp18Q5SSI6 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Utp18Q5SSI6 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Utp18Q5SSI6 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Utp18Q5SSI6 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Utp18Q5SSI6 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Utp18Q5SSI6 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Utp18Q5SSI6 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Utp18Q5SSI6 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Utp18Q5SSI6 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Utp18Q5SSI6 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Utp18Q5SSI6 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Utp18Q5SSI6 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Utp18Q5SSI6 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Utp18Q5SSI6 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Utp18Q5SSI6 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Utp18Q5SSI6 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Utp18Q5SSI6 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Utp18Q5SSI6 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Utp18Q5SSI6 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Utp18Q5SSI6 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Utp18Q5SSI6 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Utp18Q5SSI6 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Utp18Q5SSI6 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Utp18Q5SSI6 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Utp18Q5SSI6 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Utp18Q5SSI6 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Utp18Q5SSI6 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Utp18Q5SSI6 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Utp18Q5SSI6 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Utp18Q5SSI6 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Utp18Q5SSI6 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Utp18Q5SSI6 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Utp18Q5SSI6 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Utp18Q5SSI6 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Utp18Q5SSI6 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Utp18Q5SSI6 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Utp18Q5SSI6 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Utp18Q5SSI6 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Utp18Q5SSI6 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Utp18Q5SSI6 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Utp18Q5SSI6 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Utp18Q5SSI6 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Utp18Q5SSI6 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Utp18Q5SSI6 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Utp18Q5SSI6 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Utp18Q5SSI6 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Utp18Q5SSI6 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Utp18Q5SSI6 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Utp18Q5SSI6 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Utp18Q5SSI6 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Utp18Q5SSI6 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Utp18Q5SSI6 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Utp18Q5SSI6 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Utp18Q5SSI6 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Utp18Q5SSI6 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Utp18Q5SSI6 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Utp18Q5SSI6 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Utp18Q5SSI6 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Utp18Q5SSI6 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Utp18Q5SSI6 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Utp18Q5SSI6 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Utp18Q5SSI6 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Utp18Q5SSI6 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Utp18Q5SSI6 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Utp18Q5SSI6 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Utp18Q5SSI6 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Utp18Q5SSI6 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Utp18Q5SSI6 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Utp18Q5SSI6 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Utp18Q5SSI6 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Utp18Q5SSI6 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Utp18Q5SSI6 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Utp18Q5SSI6 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Utp18Q5SSI6 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Utp18Q5SSI6 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Utp18Q5SSI6 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Utp18Q5SSI6 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Utp18Q5SSI6 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Utp18Q5SSI6 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Utp18Q5SSI6 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Utp18Q5SSI6 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Utp18Q5SSI6 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Utp18Q5SSI6 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Utp18Q5SSI6 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Utp18Q5SSI6 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Utp18Q5SSI6 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Utp18Q5SSI6 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Utp18Q5SSI6 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Utp18Q5SSI6 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Utp18Q5SSI6 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Utp18Q5SSI6 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Utp18Q5SSI6 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Utp18Q5SSI6 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Utp18Q5SSI6 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms