Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPX3

Rnf215, RING finger protein 215, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf215Q5SPX3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf215Q5SPX3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf215Q5SPX3 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf215Q5SPX3 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf215Q5SPX3 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf215Q5SPX3 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf215Q5SPX3 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf215Q5SPX3 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf215Q5SPX3 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf215Q5SPX3 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf215Q5SPX3 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf215Q5SPX3 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf215Q5SPX3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf215Q5SPX3 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf215Q5SPX3 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf215Q5SPX3 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf215Q5SPX3 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf215Q5SPX3 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf215Q5SPX3 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf215Q5SPX3 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf215Q5SPX3 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf215Q5SPX3 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf215Q5SPX3 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf215Q5SPX3 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf215Q5SPX3 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf215Q5SPX3 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf215Q5SPX3 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf215Q5SPX3 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf215Q5SPX3 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf215Q5SPX3 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf215Q5SPX3 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf215Q5SPX3 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf215Q5SPX3 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf215Q5SPX3 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf215Q5SPX3 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf215Q5SPX3 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf215Q5SPX3 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf215Q5SPX3 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf215Q5SPX3 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf215Q5SPX3 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf215Q5SPX3 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf215Q5SPX3 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf215Q5SPX3 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf215Q5SPX3 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf215Q5SPX3 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf215Q5SPX3 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf215Q5SPX3 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf215Q5SPX3 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf215Q5SPX3 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf215Q5SPX3 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf215Q5SPX3 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rnf215Q5SPX3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rnf215Q5SPX3 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rnf215Q5SPX3 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Rnf215Q5SPX3 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rnf215Q5SPX3 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf215Q5SPX3 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf215Q5SPX3 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf215Q5SPX3 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf215Q5SPX3 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf215Q5SPX3 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf215Q5SPX3 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf215Q5SPX3 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf215Q5SPX3 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf215Q5SPX3 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf215Q5SPX3 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf215Q5SPX3 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf215Q5SPX3 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf215Q5SPX3 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf215Q5SPX3 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf215Q5SPX3 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf215Q5SPX3 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf215Q5SPX3 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf215Q5SPX3 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf215Q5SPX3 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf215Q5SPX3 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf215Q5SPX3 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf215Q5SPX3 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf215Q5SPX3 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf215Q5SPX3 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf215Q5SPX3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf215Q5SPX3 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf215Q5SPX3 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf215Q5SPX3 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf215Q5SPX3 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf215Q5SPX3 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf215Q5SPX3 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf215Q5SPX3 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf215Q5SPX3 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf215Q5SPX3 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf215Q5SPX3 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf215Q5SPX3 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf215Q5SPX3 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf215Q5SPX3 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf215Q5SPX3 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf215Q5SPX3 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf215Q5SPX3 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf215Q5SPX3 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf215Q5SPX3 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf215Q5SPX3 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms