Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim58Q5NCC9 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim58Q5NCC9 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim58Q5NCC9 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim58Q5NCC9 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim58Q5NCC9 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim58Q5NCC9 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim58Q5NCC9 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim58Q5NCC9 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim58Q5NCC9 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim58Q5NCC9 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim58Q5NCC9 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim58Q5NCC9 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim58Q5NCC9 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim58Q5NCC9 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim58Q5NCC9 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim58Q5NCC9 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim58Q5NCC9 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim58Q5NCC9 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim58Q5NCC9 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim58Q5NCC9 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim58Q5NCC9 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim58Q5NCC9 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim58Q5NCC9 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim58Q5NCC9 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim58Q5NCC9 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim58Q5NCC9 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim58Q5NCC9 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim58Q5NCC9 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim58Q5NCC9 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim58Q5NCC9 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim58Q5NCC9 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim58Q5NCC9 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim58Q5NCC9 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim58Q5NCC9 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim58Q5NCC9 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim58Q5NCC9 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim58Q5NCC9 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim58Q5NCC9 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim58Q5NCC9 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim58Q5NCC9 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim58Q5NCC9 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim58Q5NCC9 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim58Q5NCC9 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim58Q5NCC9 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim58Q5NCC9 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim58Q5NCC9 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim58Q5NCC9 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim58Q5NCC9 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim58Q5NCC9 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim58Q5NCC9 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim58Q5NCC9 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim58Q5NCC9 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim58Q5NCC9 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim58Q5NCC9 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim58Q5NCC9 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim58Q5NCC9 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim58Q5NCC9 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim58Q5NCC9 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim58Q5NCC9 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim58Q5NCC9 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim58Q5NCC9 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim58Q5NCC9 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim58Q5NCC9 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim58Q5NCC9 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim58Q5NCC9 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim58Q5NCC9 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim58Q5NCC9 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim58Q5NCC9 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim58Q5NCC9 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim58Q5NCC9 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim58Q5NCC9 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim58Q5NCC9 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim58Q5NCC9 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim58Q5NCC9 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim58Q5NCC9 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim58Q5NCC9 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim58Q5NCC9 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim58Q5NCC9 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim58Q5NCC9 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim58Q5NCC9 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim58Q5NCC9 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim58Q5NCC9 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim58Q5NCC9 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim58Q5NCC9 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim58Q5NCC9 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim58Q5NCC9 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim58Q5NCC9 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim58Q5NCC9 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim58Q5NCC9 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim58Q5NCC9 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim58Q5NCC9 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim58Q5NCC9 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim58Q5NCC9 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim58Q5NCC9 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim58Q5NCC9 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim58Q5NCC9 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim58Q5NCC9 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim58Q5NCC9 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim58Q5NCC9 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms