Protein–RNA interactions for Protein: Q5G5D5

Syna, Syncytin-A, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynaQ5G5D5 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SynaQ5G5D5 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms