Protein–RNA interactions for Protein: Q5D525

Syce1l, Synaptonemal complex central element protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1lQ5D525 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Syce1lQ5D525 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Syce1lQ5D525 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Syce1lQ5D525 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Syce1lQ5D525 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Syce1lQ5D525 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Syce1lQ5D525 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Syce1lQ5D525 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Syce1lQ5D525 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Syce1lQ5D525 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Syce1lQ5D525 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Syce1lQ5D525 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Syce1lQ5D525 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Syce1lQ5D525 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Syce1lQ5D525 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Syce1lQ5D525 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Syce1lQ5D525 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Syce1lQ5D525 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Syce1lQ5D525 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Syce1lQ5D525 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Syce1lQ5D525 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Syce1lQ5D525 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Syce1lQ5D525 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Syce1lQ5D525 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Syce1lQ5D525 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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