Protein–RNA interactions for Protein: Q4U4S6

Xirp2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp2Q4U4S6 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Xirp2Q4U4S6 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Xirp2Q4U4S6 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Xirp2Q4U4S6 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Xirp2Q4U4S6 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Xirp2Q4U4S6 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Xirp2Q4U4S6 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Xirp2Q4U4S6 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Xirp2Q4U4S6 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Xirp2Q4U4S6 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Xirp2Q4U4S6 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Xirp2Q4U4S6 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Xirp2Q4U4S6 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Xirp2Q4U4S6 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Xirp2Q4U4S6 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Xirp2Q4U4S6 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Xirp2Q4U4S6 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Xirp2Q4U4S6 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Xirp2Q4U4S6 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Xirp2Q4U4S6 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Xirp2Q4U4S6 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Xirp2Q4U4S6 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Xirp2Q4U4S6 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Xirp2Q4U4S6 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Xirp2Q4U4S6 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Xirp2Q4U4S6 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Xirp2Q4U4S6 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Xirp2Q4U4S6 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Xirp2Q4U4S6 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Xirp2Q4U4S6 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Xirp2Q4U4S6 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Xirp2Q4U4S6 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Xirp2Q4U4S6 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Xirp2Q4U4S6 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Xirp2Q4U4S6 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Xirp2Q4U4S6 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Xirp2Q4U4S6 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Xirp2Q4U4S6 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Xirp2Q4U4S6 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Xirp2Q4U4S6 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Xirp2Q4U4S6 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Xirp2Q4U4S6 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Xirp2Q4U4S6 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Xirp2Q4U4S6 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Xirp2Q4U4S6 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Xirp2Q4U4S6 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Xirp2Q4U4S6 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Xirp2Q4U4S6 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Xirp2Q4U4S6 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Xirp2Q4U4S6 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Xirp2Q4U4S6 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Xirp2Q4U4S6 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Xirp2Q4U4S6 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Xirp2Q4U4S6 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Xirp2Q4U4S6 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Xirp2Q4U4S6 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Xirp2Q4U4S6 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Xirp2Q4U4S6 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Xirp2Q4U4S6 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Xirp2Q4U4S6 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Xirp2Q4U4S6 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Xirp2Q4U4S6 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Xirp2Q4U4S6 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Xirp2Q4U4S6 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Xirp2Q4U4S6 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Xirp2Q4U4S6 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Xirp2Q4U4S6 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Xirp2Q4U4S6 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Xirp2Q4U4S6 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Xirp2Q4U4S6 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Xirp2Q4U4S6 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Xirp2Q4U4S6 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Xirp2Q4U4S6 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Xirp2Q4U4S6 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Xirp2Q4U4S6 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Xirp2Q4U4S6 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Xirp2Q4U4S6 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Xirp2Q4U4S6 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Xirp2Q4U4S6 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Xirp2Q4U4S6 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Xirp2Q4U4S6 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Xirp2Q4U4S6 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Xirp2Q4U4S6 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Xirp2Q4U4S6 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Xirp2Q4U4S6 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Xirp2Q4U4S6 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Xirp2Q4U4S6 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Xirp2Q4U4S6 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Xirp2Q4U4S6 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Xirp2Q4U4S6 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Xirp2Q4U4S6 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Xirp2Q4U4S6 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Xirp2Q4U4S6 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Xirp2Q4U4S6 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Xirp2Q4U4S6 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Xirp2Q4U4S6 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Xirp2Q4U4S6 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Xirp2Q4U4S6 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Xirp2Q4U4S6 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Xirp2Q4U4S6 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms