Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shank3Q4ACU6 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Shank3Q4ACU6 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Shank3Q4ACU6 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Shank3Q4ACU6 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Shank3Q4ACU6 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Shank3Q4ACU6 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Shank3Q4ACU6 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Shank3Q4ACU6 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Shank3Q4ACU6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Shank3Q4ACU6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Shank3Q4ACU6 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Shank3Q4ACU6 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Shank3Q4ACU6 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Shank3Q4ACU6 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Shank3Q4ACU6 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Shank3Q4ACU6 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Shank3Q4ACU6 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Shank3Q4ACU6 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Shank3Q4ACU6 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Shank3Q4ACU6 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Shank3Q4ACU6 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Shank3Q4ACU6 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Shank3Q4ACU6 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Shank3Q4ACU6 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Shank3Q4ACU6 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Shank3Q4ACU6 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Shank3Q4ACU6 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Shank3Q4ACU6 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Shank3Q4ACU6 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Shank3Q4ACU6 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Shank3Q4ACU6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Shank3Q4ACU6 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Shank3Q4ACU6 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Shank3Q4ACU6 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Shank3Q4ACU6 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Shank3Q4ACU6 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Shank3Q4ACU6 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Shank3Q4ACU6 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Shank3Q4ACU6 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Shank3Q4ACU6 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Shank3Q4ACU6 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms