Protein–RNA interactions for Protein: Q497I4

Krt35, Keratin, type I cuticular Ha5, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt35Q497I4 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt35Q497I4 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms