Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZN08

Fam220a, Protein FAM220A, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam220aQ3ZN08 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam220aQ3ZN08 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam220aQ3ZN08 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam220aQ3ZN08 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam220aQ3ZN08 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam220aQ3ZN08 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam220aQ3ZN08 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam220aQ3ZN08 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam220aQ3ZN08 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam220aQ3ZN08 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam220aQ3ZN08 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam220aQ3ZN08 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam220aQ3ZN08 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam220aQ3ZN08 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam220aQ3ZN08 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam220aQ3ZN08 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam220aQ3ZN08 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam220aQ3ZN08 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam220aQ3ZN08 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam220aQ3ZN08 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam220aQ3ZN08 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Fam220aQ3ZN08 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Fam220aQ3ZN08 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Fam220aQ3ZN08 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Fam220aQ3ZN08 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fam220aQ3ZN08 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fam220aQ3ZN08 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fam220aQ3ZN08 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Fam220aQ3ZN08 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fam220aQ3ZN08 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fam220aQ3ZN08 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fam220aQ3ZN08 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fam220aQ3ZN08 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Fam220aQ3ZN08 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fam220aQ3ZN08 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fam220aQ3ZN08 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fam220aQ3ZN08 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fam220aQ3ZN08 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fam220aQ3ZN08 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fam220aQ3ZN08 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fam220aQ3ZN08 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fam220aQ3ZN08 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fam220aQ3ZN08 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fam220aQ3ZN08 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fam220aQ3ZN08 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fam220aQ3ZN08 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fam220aQ3ZN08 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fam220aQ3ZN08 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fam220aQ3ZN08 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fam220aQ3ZN08 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fam220aQ3ZN08 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fam220aQ3ZN08 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fam220aQ3ZN08 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fam220aQ3ZN08 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fam220aQ3ZN08 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fam220aQ3ZN08 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fam220aQ3ZN08 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fam220aQ3ZN08 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fam220aQ3ZN08 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Fam220aQ3ZN08 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fam220aQ3ZN08 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fam220aQ3ZN08 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fam220aQ3ZN08 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Fam220aQ3ZN08 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fam220aQ3ZN08 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fam220aQ3ZN08 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fam220aQ3ZN08 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fam220aQ3ZN08 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fam220aQ3ZN08 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fam220aQ3ZN08 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fam220aQ3ZN08 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fam220aQ3ZN08 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fam220aQ3ZN08 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fam220aQ3ZN08 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fam220aQ3ZN08 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fam220aQ3ZN08 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fam220aQ3ZN08 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fam220aQ3ZN08 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fam220aQ3ZN08 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fam220aQ3ZN08 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fam220aQ3ZN08 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fam220aQ3ZN08 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fam220aQ3ZN08 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fam220aQ3ZN08 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fam220aQ3ZN08 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fam220aQ3ZN08 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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