Protein–RNA interactions for Protein: Q3V209

Tmub2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmub2Q3V209 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmub2Q3V209 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmub2Q3V209 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmub2Q3V209 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmub2Q3V209 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmub2Q3V209 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmub2Q3V209 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmub2Q3V209 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmub2Q3V209 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmub2Q3V209 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmub2Q3V209 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmub2Q3V209 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmub2Q3V209 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmub2Q3V209 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmub2Q3V209 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmub2Q3V209 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmub2Q3V209 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmub2Q3V209 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmub2Q3V209 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmub2Q3V209 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmub2Q3V209 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmub2Q3V209 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmub2Q3V209 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmub2Q3V209 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmub2Q3V209 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmub2Q3V209 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmub2Q3V209 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmub2Q3V209 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmub2Q3V209 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmub2Q3V209 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmub2Q3V209 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmub2Q3V209 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmub2Q3V209 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmub2Q3V209 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmub2Q3V209 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmub2Q3V209 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmub2Q3V209 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmub2Q3V209 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmub2Q3V209 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmub2Q3V209 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmub2Q3V209 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmub2Q3V209 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmub2Q3V209 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmub2Q3V209 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmub2Q3V209 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmub2Q3V209 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmub2Q3V209 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmub2Q3V209 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmub2Q3V209 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmub2Q3V209 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmub2Q3V209 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmub2Q3V209 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmub2Q3V209 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmub2Q3V209 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmub2Q3V209 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmub2Q3V209 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmub2Q3V209 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmub2Q3V209 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmub2Q3V209 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmub2Q3V209 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmub2Q3V209 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmub2Q3V209 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmub2Q3V209 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmub2Q3V209 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmub2Q3V209 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmub2Q3V209 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmub2Q3V209 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmub2Q3V209 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmub2Q3V209 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmub2Q3V209 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmub2Q3V209 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmub2Q3V209 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Tmub2Q3V209 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Tmub2Q3V209 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Tmub2Q3V209 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Tmub2Q3V209 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmub2Q3V209 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmub2Q3V209 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmub2Q3V209 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmub2Q3V209 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmub2Q3V209 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmub2Q3V209 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmub2Q3V209 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmub2Q3V209 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmub2Q3V209 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmub2Q3V209 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmub2Q3V209 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmub2Q3V209 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmub2Q3V209 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmub2Q3V209 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmub2Q3V209 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmub2Q3V209 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmub2Q3V209 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmub2Q3V209 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmub2Q3V209 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmub2Q3V209 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmub2Q3V209 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmub2Q3V209 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmub2Q3V209 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmub2Q3V209 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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