Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1V3

Esf1, ESF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 845 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Esf1Q3V1V3 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Esf1Q3V1V3 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Esf1Q3V1V3 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Esf1Q3V1V3 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Esf1Q3V1V3 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Esf1Q3V1V3 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Esf1Q3V1V3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Esf1Q3V1V3 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Esf1Q3V1V3 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Esf1Q3V1V3 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Esf1Q3V1V3 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Esf1Q3V1V3 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Esf1Q3V1V3 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Esf1Q3V1V3 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Esf1Q3V1V3 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Esf1Q3V1V3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Esf1Q3V1V3 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Esf1Q3V1V3 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Esf1Q3V1V3 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Esf1Q3V1V3 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Esf1Q3V1V3 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Esf1Q3V1V3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Esf1Q3V1V3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Esf1Q3V1V3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Esf1Q3V1V3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Esf1Q3V1V3 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Esf1Q3V1V3 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Esf1Q3V1V3 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Esf1Q3V1V3 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Esf1Q3V1V3 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Esf1Q3V1V3 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Esf1Q3V1V3 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Esf1Q3V1V3 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Esf1Q3V1V3 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Esf1Q3V1V3 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Esf1Q3V1V3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Esf1Q3V1V3 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Esf1Q3V1V3 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Esf1Q3V1V3 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Esf1Q3V1V3 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Esf1Q3V1V3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Esf1Q3V1V3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Esf1Q3V1V3 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Esf1Q3V1V3 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Esf1Q3V1V3 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Esf1Q3V1V3 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Esf1Q3V1V3 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Esf1Q3V1V3 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Esf1Q3V1V3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Esf1Q3V1V3 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Esf1Q3V1V3 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Esf1Q3V1V3 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Esf1Q3V1V3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Esf1Q3V1V3 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Esf1Q3V1V3 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Esf1Q3V1V3 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Esf1Q3V1V3 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Esf1Q3V1V3 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Esf1Q3V1V3 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Esf1Q3V1V3 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Esf1Q3V1V3 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Esf1Q3V1V3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Esf1Q3V1V3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Esf1Q3V1V3 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Esf1Q3V1V3 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Esf1Q3V1V3 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Esf1Q3V1V3 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Esf1Q3V1V3 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Esf1Q3V1V3 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Esf1Q3V1V3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Esf1Q3V1V3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Esf1Q3V1V3 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Esf1Q3V1V3 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Esf1Q3V1V3 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Esf1Q3V1V3 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Esf1Q3V1V3 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Esf1Q3V1V3 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Esf1Q3V1V3 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Esf1Q3V1V3 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Esf1Q3V1V3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Esf1Q3V1V3 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Esf1Q3V1V3 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Esf1Q3V1V3 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Esf1Q3V1V3 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Esf1Q3V1V3 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Esf1Q3V1V3 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Esf1Q3V1V3 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Esf1Q3V1V3 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Esf1Q3V1V3 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Esf1Q3V1V3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Esf1Q3V1V3 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Esf1Q3V1V3 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Esf1Q3V1V3 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Esf1Q3V1V3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Esf1Q3V1V3 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Esf1Q3V1V3 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Esf1Q3V1V3 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Esf1Q3V1V3 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Esf1Q3V1V3 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Esf1Q3V1V3 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms