Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms