Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc185Q3V118 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms