Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0G7

Garnl3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garnl3Q3V0G7 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Garnl3Q3V0G7 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms