Protein–RNA interactions for Protein: Q3V061

Trim80, Tripartite motif-containing 80, mousemouse

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Length 624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim80Q3V061 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Trim80Q3V061 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Trim80Q3V061 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim80Q3V061 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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