Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWX6

E330034G19Rik, RIKEN cDNA E330034G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
E330034G19RikQ3UWX6 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms