Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Capn13Q3UW68 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms