Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BB287469Q3UT53 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BB287469Q3UT53 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BB287469Q3UT53 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BB287469Q3UT53 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BB287469Q3UT53 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BB287469Q3UT53 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BB287469Q3UT53 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
BB287469Q3UT53 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
BB287469Q3UT53 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
BB287469Q3UT53 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
BB287469Q3UT53 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
BB287469Q3UT53 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
BB287469Q3UT53 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
BB287469Q3UT53 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
BB287469Q3UT53 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BB287469Q3UT53 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
BB287469Q3UT53 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BB287469Q3UT53 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BB287469Q3UT53 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BB287469Q3UT53 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
BB287469Q3UT53 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BB287469Q3UT53 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BB287469Q3UT53 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BB287469Q3UT53 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BB287469Q3UT53 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BB287469Q3UT53 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BB287469Q3UT53 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
BB287469Q3UT53 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BB287469Q3UT53 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BB287469Q3UT53 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BB287469Q3UT53 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BB287469Q3UT53 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BB287469Q3UT53 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BB287469Q3UT53 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BB287469Q3UT53 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BB287469Q3UT53 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BB287469Q3UT53 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BB287469Q3UT53 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BB287469Q3UT53 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BB287469Q3UT53 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BB287469Q3UT53 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BB287469Q3UT53 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BB287469Q3UT53 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BB287469Q3UT53 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BB287469Q3UT53 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
BB287469Q3UT53 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BB287469Q3UT53 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BB287469Q3UT53 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BB287469Q3UT53 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
BB287469Q3UT53 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
BB287469Q3UT53 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
BB287469Q3UT53 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BB287469Q3UT53 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
BB287469Q3UT53 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BB287469Q3UT53 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BB287469Q3UT53 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BB287469Q3UT53 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BB287469Q3UT53 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BB287469Q3UT53 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BB287469Q3UT53 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BB287469Q3UT53 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BB287469Q3UT53 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BB287469Q3UT53 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BB287469Q3UT53 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BB287469Q3UT53 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BB287469Q3UT53 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BB287469Q3UT53 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BB287469Q3UT53 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BB287469Q3UT53 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BB287469Q3UT53 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BB287469Q3UT53 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BB287469Q3UT53 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BB287469Q3UT53 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BB287469Q3UT53 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BB287469Q3UT53 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BB287469Q3UT53 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BB287469Q3UT53 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BB287469Q3UT53 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BB287469Q3UT53 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BB287469Q3UT53 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BB287469Q3UT53 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BB287469Q3UT53 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BB287469Q3UT53 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BB287469Q3UT53 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BB287469Q3UT53 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BB287469Q3UT53 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BB287469Q3UT53 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms