Protein–RNA interactions for Protein: Q3USW4

B230104I21Rik, RIKEN cDNA B230104I21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B230104I21RikQ3USW4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
B230104I21RikQ3USW4 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms