Protein–RNA interactions for Protein: Q3USS0

Gm6899, Predicted gene 6899, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6899Q3USS0 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6899Q3USS0 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
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