Protein–RNA interactions for Protein: Q3US16

Tceanc, Transcription elongation factor A N-terminal and central domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TceancQ3US16 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TceancQ3US16 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TceancQ3US16 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TceancQ3US16 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TceancQ3US16 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TceancQ3US16 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TceancQ3US16 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TceancQ3US16 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TceancQ3US16 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TceancQ3US16 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TceancQ3US16 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TceancQ3US16 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TceancQ3US16 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TceancQ3US16 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TceancQ3US16 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TceancQ3US16 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TceancQ3US16 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TceancQ3US16 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TceancQ3US16 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms