Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc33Q3ULW6 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc33Q3ULW6 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc33Q3ULW6 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc33Q3ULW6 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc33Q3ULW6 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc33Q3ULW6 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc33Q3ULW6 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc33Q3ULW6 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc33Q3ULW6 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc33Q3ULW6 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc33Q3ULW6 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc33Q3ULW6 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc33Q3ULW6 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc33Q3ULW6 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc33Q3ULW6 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc33Q3ULW6 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc33Q3ULW6 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc33Q3ULW6 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc33Q3ULW6 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc33Q3ULW6 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc33Q3ULW6 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc33Q3ULW6 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc33Q3ULW6 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc33Q3ULW6 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc33Q3ULW6 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc33Q3ULW6 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ccdc33Q3ULW6 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ccdc33Q3ULW6 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ccdc33Q3ULW6 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ccdc33Q3ULW6 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms