Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms