Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHF3

Mier3, Mesoderm induction early response protein 3, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mier3Q3UHF3 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mier3Q3UHF3 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mier3Q3UHF3 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mier3Q3UHF3 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mier3Q3UHF3 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mier3Q3UHF3 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Mier3Q3UHF3 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mier3Q3UHF3 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mier3Q3UHF3 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mier3Q3UHF3 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mier3Q3UHF3 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Mier3Q3UHF3 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mier3Q3UHF3 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mier3Q3UHF3 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mier3Q3UHF3 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mier3Q3UHF3 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mier3Q3UHF3 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mier3Q3UHF3 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mier3Q3UHF3 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mier3Q3UHF3 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mier3Q3UHF3 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mier3Q3UHF3 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mier3Q3UHF3 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mier3Q3UHF3 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mier3Q3UHF3 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mier3Q3UHF3 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mier3Q3UHF3 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mier3Q3UHF3 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mier3Q3UHF3 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mier3Q3UHF3 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Mier3Q3UHF3 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Mier3Q3UHF3 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mier3Q3UHF3 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mier3Q3UHF3 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mier3Q3UHF3 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mier3Q3UHF3 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mier3Q3UHF3 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mier3Q3UHF3 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mier3Q3UHF3 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mier3Q3UHF3 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mier3Q3UHF3 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mier3Q3UHF3 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mier3Q3UHF3 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mier3Q3UHF3 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mier3Q3UHF3 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mier3Q3UHF3 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mier3Q3UHF3 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mier3Q3UHF3 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mier3Q3UHF3 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mier3Q3UHF3 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mier3Q3UHF3 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mier3Q3UHF3 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mier3Q3UHF3 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mier3Q3UHF3 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mier3Q3UHF3 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mier3Q3UHF3 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mier3Q3UHF3 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mier3Q3UHF3 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mier3Q3UHF3 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mier3Q3UHF3 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Mier3Q3UHF3 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mier3Q3UHF3 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mier3Q3UHF3 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mier3Q3UHF3 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mier3Q3UHF3 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mier3Q3UHF3 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mier3Q3UHF3 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mier3Q3UHF3 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Mier3Q3UHF3 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mier3Q3UHF3 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mier3Q3UHF3 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mier3Q3UHF3 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mier3Q3UHF3 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mier3Q3UHF3 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mier3Q3UHF3 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mier3Q3UHF3 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mier3Q3UHF3 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mier3Q3UHF3 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mier3Q3UHF3 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mier3Q3UHF3 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Mier3Q3UHF3 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mier3Q3UHF3 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mier3Q3UHF3 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Mier3Q3UHF3 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Mier3Q3UHF3 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Mier3Q3UHF3 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mier3Q3UHF3 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mier3Q3UHF3 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Mier3Q3UHF3 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mier3Q3UHF3 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mier3Q3UHF3 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mier3Q3UHF3 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mier3Q3UHF3 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mier3Q3UHF3 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mier3Q3UHF3 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mier3Q3UHF3 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mier3Q3UHF3 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mier3Q3UHF3 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mier3Q3UHF3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mier3Q3UHF3 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms