Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms