Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGP9

Lrrc58, Leucine-rich repeat-containing protein 58, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc58Q3UGP9 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Lrrc58Q3UGP9 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Lrrc58Q3UGP9 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Lrrc58Q3UGP9 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Lrrc58Q3UGP9 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
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Lrrc58Q3UGP9 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Lrrc58Q3UGP9 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Lrrc58Q3UGP9 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms