Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD82

Parp8, Poly [ADP-ribose] polymerase 8, mousemouse

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Length 852 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp8Q3UD82 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Parp8Q3UD82 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Parp8Q3UD82 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Parp8Q3UD82 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Parp8Q3UD82 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Parp8Q3UD82 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Parp8Q3UD82 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Parp8Q3UD82 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Parp8Q3UD82 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Parp8Q3UD82 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Parp8Q3UD82 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Parp8Q3UD82 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Parp8Q3UD82 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Parp8Q3UD82 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Parp8Q3UD82 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Parp8Q3UD82 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Parp8Q3UD82 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Parp8Q3UD82 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Parp8Q3UD82 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Parp8Q3UD82 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Parp8Q3UD82 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Parp8Q3UD82 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Parp8Q3UD82 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Parp8Q3UD82 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Parp8Q3UD82 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Parp8Q3UD82 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Parp8Q3UD82 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Parp8Q3UD82 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Parp8Q3UD82 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Parp8Q3UD82 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Parp8Q3UD82 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Parp8Q3UD82 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Parp8Q3UD82 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Parp8Q3UD82 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Parp8Q3UD82 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Parp8Q3UD82 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Parp8Q3UD82 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Parp8Q3UD82 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Parp8Q3UD82 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Parp8Q3UD82 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Parp8Q3UD82 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Parp8Q3UD82 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Parp8Q3UD82 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Parp8Q3UD82 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Parp8Q3UD82 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Parp8Q3UD82 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Parp8Q3UD82 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Parp8Q3UD82 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Parp8Q3UD82 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Parp8Q3UD82 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Parp8Q3UD82 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Parp8Q3UD82 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Parp8Q3UD82 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Parp8Q3UD82 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Parp8Q3UD82 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Parp8Q3UD82 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Parp8Q3UD82 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Parp8Q3UD82 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Parp8Q3UD82 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Parp8Q3UD82 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Parp8Q3UD82 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Parp8Q3UD82 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Parp8Q3UD82 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Parp8Q3UD82 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Parp8Q3UD82 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Parp8Q3UD82 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Parp8Q3UD82 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Parp8Q3UD82 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Parp8Q3UD82 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Parp8Q3UD82 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Parp8Q3UD82 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Parp8Q3UD82 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Parp8Q3UD82 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Parp8Q3UD82 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Parp8Q3UD82 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Parp8Q3UD82 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Parp8Q3UD82 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Parp8Q3UD82 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Parp8Q3UD82 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Parp8Q3UD82 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Parp8Q3UD82 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Parp8Q3UD82 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Parp8Q3UD82 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Parp8Q3UD82 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Parp8Q3UD82 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Parp8Q3UD82 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Parp8Q3UD82 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Parp8Q3UD82 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Parp8Q3UD82 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Parp8Q3UD82 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Parp8Q3UD82 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Parp8Q3UD82 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Parp8Q3UD82 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Parp8Q3UD82 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Parp8Q3UD82 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Parp8Q3UD82 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Parp8Q3UD82 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Parp8Q3UD82 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Parp8Q3UD82 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Parp8Q3UD82 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms