Protein–RNA interactions for Protein: Q3UBG2

Pid1, PTB-containing, cubilin and LRP1-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pid1Q3UBG2 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms