Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms